《大连海洋大学学报》（原名《大连水产学院学报》）于1980年创刊，1986年以前属于内部交流刊物。1986年12月，经中共辽宁省委宣传部批准，正式成为国内外公开发行刊物。2010年5月，经新闻出版总署批准（新闻出版总署新出审字[2010]781号文件），《大连水产学院学报》随着学校的更名也于2010年第3期更名为《大连海洋大学学报》。

《大连海洋大学学报》是以刊载海洋、水产及其相关学科研究论文的综合性学术刊物，双月刊，国内外公开发行。主要刊登内容为水生生物、生物技术、水产增养殖与病害防治、海洋生态与环境、海洋渔业、渔业资源、水产捕捞、水产品加工、渔业机械、航海技术与轮机管理、渔船设计与制造等学科的研究论文、综述等。2006年获首届中国高校特色科技期刊奖；2004年获全国高校科技期刊优秀编辑出版质量奖；在期刊等级评定中，1999至2010年本刊连续6次被评为辽宁省一级期刊；1992至2012年本刊已连续6次被确定为全国中文核心期刊。多次在全国优秀高校自然科学学报评比中获奖。现已被美国《化学文摘》、ASFA《水科学和渔业文摘》以及俄罗斯的《文摘杂志》等10余家国内外检索刊物、数据库列为收录刊源；1995年全国高等农业院校学报“三优”评比一等奖；1998年全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技期刊评比三等奖。